Vähk: need 4 geeni aitavad ennustada tulemust
Tuumori supressori p53 rolli põhjalikud uuringud pakuvad paremat arusaamist geneetilistest mutatsioonidest, mis on vähi erinevates vormides mängul, samuti tuvastatakse neli geeni, mis võivad aidata inimese väljavaadet ennustada.
The TP53 geen vastutab kodeerimise eest, mida teadlased nimetavad kasvajavalkuks p53 - kasvaja supressor, mis võib peatada rakkude liiga kiire jagunemise ja paljunemise.
Teadlased on dubleerinud TP53 "genoomi valvur", kuna sellel on oluline roll kasvajate ennetamisel ja rakkude jagunemise kontrolli all hoidmisel.
Inimvähkidel on sageli mutatsioonid TP53 geen, põhjustades vähi vastu ühe kriitilise kaitsemehhanismi tõrke.
Esimesed uuringud, mis tuvastasid TP53 inimvähi mutatsioonid ilmnesid 1980. aastatel ja sellest ajast alates on teadlased pühendanud palju aega ja ressursse selle rolli selgitamiseks vähktõves.
Nüüd kasutab suurim omataoline uuring enam kui 10 000 vähihaige kasvajaproove ja uurib 32 erinevat tüüpi vähki, et paremini mõista TP53.
TX Houstoni Baylori meditsiinikolledži molekulaarviroloogia ja mikrobioloogia professor dr Larry Donehower juhtis uut uurimistööd, mis ilmub ajakirjas Lahtriaruanded.
Telltale 4 geenid võivad aidata väljavaateid ennustada
Dr Donehower ja meeskond kasutasid 32 vähi 1025 proovi väljavõtmiseks viit erinevat andmeplatvormi. Vähi genoomi atlase (TCGA) abil suutsid teadlased hinnata igakülgselt p53 raja rolli nendes 32 vähis.
Seejärel võrdlesid dr Donehower ja tema kolleegid TCGA andmeid teise 80 000 geneetiliste mutatsioonide andmebaasiga, mille dr Thierry Soussi - Prantsusmaal Pariisis Sorbonne'i ülikooli molekulaarbioloogia professor - oli kokku kogunud 30 aasta jooksul.
Teadlased leidsid, et TP53 mutatsioonid esinesid sagedamini kehvema ilmega inimestel. Lisaks leiti analüüsist, et „enam kui 91% vähkkasvajatest TP53 mutatsioonid näitavad mõlema funktsionaalse kadu TP53 alleelid ”või geenivariandid.
Dr Donehower selgitab: "Mõnes vähigeenis näete kahest geenist ühe eksemplari kadunud või muteerunud", kuid "üle 91 protsendi kõigist vähkidest kaotavad mõlemad TP53 geenid, mitte ainult üks. "
Autorite kirjutatud teine alleelikaotus tekkis "mutatsiooni, kromosoomide kustutamise või heterosügootsuse koopianeutraalse kadumise kaudu" - see tähendab geenide dubleerimisel. Juhtivteadur märgib ka, et see viimane protsess toimus palju sagedamini, kui nad varem arvasid.
Oluline on see, et uuringus tuvastati ka neli geeni, mis näitasid mutantides üleekspressiooni TP53 kasvajad. Teadlaste sõnul võivad need neli geeni "öelda", kas vähihaigel on hea väljavaade või mitte.
"Kui teil on nende nelja geeni kõrge ekspressioon, on teil patsient, kellel on tõenäolisem halb prognoos […] Ja vastupidi, kui sellel patsiendil on nende geenide ekspressioon väga madal, elab ta tõenäoliselt kauem ja tal on hea prognoos. ”
Dr Larry Donehower
"See annab teile parema pildi sellest, kuidas tal läheb, kui lihtsalt teadmine, kas ta on mutantne TP53 või mitte, ”jätkab dr Donehower.
Lõpuks oli uuring tugevalt seotud TP53 mutatsioonid genoomse ebastabiilsusega, mis on kooskõlas järeldusega TP53Tüüpiline roll „genoomi valvurina“.
Dr Donehower kommenteerib uue uuringu ainulaadsust, öeldes: „Enamik uurib TP53 keskenduda ühele vähitüübile. ”
"Vaadates 32 erinevat vähitüüpi, näete, et teatud mustrid püsivad vähi tüübist sõltumata."
Baylori meditsiinikolledži uuringu kaasautor ja vähi genoomika direktor dr David Wheeler kommenteerib ka järelduste olulisust.
Ta ütleb: „Alates sellest ajast TP53 on vähi ennetamisel üks olulisemaid väravavahte, mida paremini me sellest geenist aru saame, seda paremini suudame mõista vähi põhibioloogiat. See toob kaasa parema ravi. ”
